Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CgnP59242 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CgnP59242 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CgnP59242 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CgnP59242 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CgnP59242 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CgnP59242 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CgnP59242 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CgnP59242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CgnP59242 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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