Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup43P59235 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms