Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P58686 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P58686 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P58686 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P58686 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P58686 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P58686 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P58686 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P58686 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P58686 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P58686 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms