Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smpdl3bP58242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smpdl3bP58242 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms