Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp20P57748 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mmp20P57748 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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