Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NcstnP57716 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NcstnP57716 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms