Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn18P56857 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cldn18P56857 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn18P56857 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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