Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd5P56812 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd5P56812 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pdcd5P56812 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms