Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp5P56399 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp5P56399 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp5P56399 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp5P56399 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms