Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab4aP56371 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab4aP56371 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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