Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp1P56183 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms