Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab2aP53994 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms