Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PctpP53808 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PctpP53808 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PctpP53808 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PctpP53808 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PctpP53808 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PctpP53808 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PctpP53808 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PctpP53808 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PctpP53808 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms