Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fdft1P53798 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fdft1P53798 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms