Protein–RNA interactions for Protein: P52800

Efnb2, Ephrin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb2P52800 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efnb2P52800 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms