Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efnb1P52795 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Efnb1P52795 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms