Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apobec1P51908 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec1P51908 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec1P51908 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms