Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccr3P51678 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccr3P51678 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms