Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa8P50706 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms