Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LtbrP50284 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LtbrP50284 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LtbrP50284 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms