Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms