Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-1P50220 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx2-1P50220 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms