Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VdrP48281 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VdrP48281 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VdrP48281 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VdrP48281 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VdrP48281 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VdrP48281 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VdrP48281 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VdrP48281 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VdrP48281 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VdrP48281 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VdrP48281 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VdrP48281 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms