Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RpiaP47968 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RpiaP47968 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms