Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn1bP46414 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms