Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klf1P46099 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klf1P46099 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klf1P46099 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms