Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hist1h1bP43276 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hist1h1bP43276 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms