Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sept1P42209 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sept1P42209 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept1P42209 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sept1P42209 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept1P42209 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept1P42209 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms