Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd9P40240 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd9P40240 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms