Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Grik2P39087 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Grik2P39087 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms