Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PpargP37238 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PpargP37238 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PpargP37238 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PpargP37238 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PpargP37238 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PpargP37238 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PpargP37238 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PpargP37238 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms