Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sar1aP36536 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms