Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddit3P35639 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms