Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ly6dP35459 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ly6dP35459 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms