Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Grin2aP35436 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Grin2aP35436 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Grin2aP35436 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms