Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab20P35295 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab20P35295 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab20P35295 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms