Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkcdP28867 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcdP28867 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms