Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprmP28828 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprmP28828 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtprmP28828 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprmP28828 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprmP28828 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprmP28828 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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