Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NapbP28663 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NapbP28663 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NapbP28663 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NapbP28663 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NapbP28663 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NapbP28663 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NapbP28663 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NapbP28663 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NapbP28663 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NapbP28663 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms