Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col2a1P28481 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col2a1P28481 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col2a1P28481 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col2a1P28481 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col2a1P28481 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms