Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxd10P28359 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Hoxd10P28359 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Hoxd10P28359 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Hoxd10P28359 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Hoxd10P28359 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Hoxd10P28359 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Hoxd10P28359 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd10P28359 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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