Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BrafP28028 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BrafP28028 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BrafP28028 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BrafP28028 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BrafP28028 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BrafP28028 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BrafP28028 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BrafP28028 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms