Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pde6aP27664 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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