Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
U2af2P26369 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U2af2P26369 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms