Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccnd1P25322 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccnd1P25322 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms