Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col8a2P25318 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms