Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd11P23813 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd11P23813 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms