Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkchP23298 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkchP23298 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkchP23298 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkchP23298 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 4359.9 ms