Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd3eP22646 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd3eP22646 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms