Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifrd1P19182 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifrd1P19182 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms